Compte rendu du 24/04/2023 (bureau)

CR Réunion du Bureau SAIN du 24 mai 2023

Présents :

• Benjamin Lemasson
• Sabrina Doblas
• Denis Grenier
• Aurélien Trotier
• Emeline Ribot
• Pierre-Antoine Eliat
• Frank Kober

Ordre du jour :

• Partage séquences
• Séquence anatomique à intégrer dans les protocoles
• Animation du réseau (formation etc)
• Discord vs Slack (+ github)
• Prochaine réunion

Partage des données sur Shanoir

Présentation de l’utilisation Shanoir pour le petit-animal à prévoir

• lien ?
• création de compte
• démo !
• Un récapitulatif avec le lien actuel et les informations sur comment se connecter à envoyer par email à la liste SAIN
• contacter M. Dojat à ce sujet

En attendant un système de licenses à plusieurs niveaux (du type CC BY 4.0 et co-authorship) : Définir que de base les données sont en accès restreintes: la réutilisatiion des données nécessite une autorisation explicite des propriétaires Benjamin Quel est le devenir de Shanoir (et de son instance recherche ouverte actuelle) Benjamin

Si nous pouvons toujours utiliser cette instance Shanoir SA

Solliciter le dépôt de quelques données d’exemple de chacun au moment de la réunion du 27 juin

Partage des séquences

La liste des séquences est disponible dans un google doc sur le drive de Aurélien Trotier. Le lien est disponible sur le wiki-sain : https://docs.google.com/spreadsheets/d/1d61kCkBsC3j1pOHhouFSFcIx8NUw6T1h71vGddJWPG8/edit#gid=0

Ajout du lien sur le site et repartage de l’information lors de la présentation github Aurélien

Protocole standard

Définir un protocol de routine neuro/foie pour rat/souris pour une anatomique T1w et/ou T2w.

Discussion sur comment pousser ça sur Shanoir facilement

-> Récupération des protocoles de routine de chaque laboratoire et analyse des paramètres Aurélien

Animation SAIN

Présentation de sujets spécifiques notamment sur la pratique d’expérimentation (Gestion de l’animal (ECG, température, positonnement, positionnement des coupes, scout…) durant la réunion du SAIN pour motiver les gens à venir et chercher des sujets :)

Proposition de breakout rooms sur des sujet précis (sans présentation) mais avec un compte rendu qui serait rédigé par les personnes qui sollicitent de l’aide sur le sujet traité.

Collecte de propositions des sujets précis à solliciter au moment de l’appel à la prochaine réunion du 27 juin

TO DO

• organisation de la réunion SAIN 27 juin 2023 à 10h (-> ordre du jour ????)