Compte rendu du 19/06/2025 | Small Animal Imaging Network
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Compte rendu du 19/06/2025

Compte rendu du 19/06/2025

CR réunion SAIN du 19 juin 2025

Date : 2025-06-19

Ordre du jour

  • Initiative Pulseq
  • Présentation ESMRMB preclinical day 8 octobre
    • Sain network -> 13h45:14:05
    • Quoi présenter ?
  • GTs : analyse des GTs https://framaforms.org/participation-a-un-groupe-de-travail-1746448849
  • Participation FC3R ?
  • Organisation du webinaire impression 3D
    • centralisation des fichiers
    • Liste des fichiers ?
    • Regroupement par thème ?
    • Définir les pièces importantes à partager

Compte rendu

Participation GT

  • GT 1 : Préparation des animaux pour l’imagerie : référencement des pratiques et recommandations pour les conditions optimales de préparation (en particulier, température et anesthésie)
  • GT 2 : Fantômes et métrologie : référencement des pratiques et tests de reproductibilité/répétabilité de fabrication de fantômes et mesures quantitatives
  • GT 3 : Base de données image + processing : Mise en place d’une base de données d’image commune pour créer des outils de post-processing (asegmentation etc)
  • lien formulaire : https://framaforms.org/participation-a-un-groupe-de-travail-1746448849
  • 8 réponses
  • GT1

    MAGAT Julie julie.magat@ihu-liryc.fr Desmoulin Franck franck.desmoulin@inserm.fr ELIAT Pierre-Antoine pierre-antoine.eliat@univ-rennes.fr Mallem Sami sami.mallem@inserm.fr

  • GT2

    Soustelle Lucas lucas.soustelle@univ-amu.fr ELIAT Pierre-Antoine pierre-antoine.eliat@univ-rennes.fr Mallem Sami sami.mallem@inserm.fr nihou yassine nihou.yassine@gmail.com

  • GT3

    TROTIER Aurélien aurelien.trotier@rmsb.u-bordeaux.fr Lemasson Benjamin benjamin.lemasson@uni-grenoble-alpes.fr Soustelle Lucas lucas.soustelle@univ-amu.fr MAGAT Julie julie.magat@ihu-liryc.fr ELIAT Pierre-Antoine pierre-antoine.eliat@univ-rennes.fr nihou yassine nihou.yassine@gmail.com

Pulseq

  • ouverture topic sur le forum bruker
  • Intérêt montré par : 9 personnes
  • dont Matthew D. Budde -> transfert de l’interpréteur en C (merci ChatGPT)
  • 2 répertoires disponibles
    • public: https://github.com/mdbudde/bruker_pulseq (interpreteur sans bruker)
    • Private : https://github.com/mdbudde/bruker_pulseq_private (avec code bruker)
    • Potentiellement transférer à terme sur le réseau SAIN ou l’organisation Pulseq
  • Résultats préliminaires :
    • Séquence converti en ppg
    • Duty cycle + Simu fonctionne

ESMRMB : préparation présentation

  • Présentation SAIN
    • Réseau francophone
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